من العلامات التي قد تدل على وجود التهاب المجاري البولية عند حديثي الولادة و الاطفال حرارة ,هيجان الطفل و سرعة استثارته , فقدان شهية, ألم بطني, اسهال ,اقياء, بكاء اثناء عملية التبول, رائحة بول قوية واخزة , زيادة عدد الكريات البيض في الدم و قيم مرتفعة من البـروتين سي التفاعلي CRP.
كما أن وجود بيلة كريات بيضاء (ظهور الكريات البيضاء في البول) يعتبر ذات قيمة تشخيصية جيدة و توصي جمعية طب الاطفال الالمانية و الأكاديمية الامريكية لطب الاطفال بالعمل على استبعاد وجود التهاب مجاري بولية عند الاطفال بين عمر شهرين و سنتين الذين يشكون من ارتفاع حرارة غير مفسر.
كما وترتفع القيمة التشخيصية لتحليل البول إلى اكثر من 80% في حال وجود جراثيم و كريات بيضاء معا في عينة البول المأخوذة عبر قثطرة بولية .
عينة البول المثالية لدراسة التهاب مجاري بولية هي عينة البول المجموعة من خلال عملية بزل المثانة فوق العانة.
يعتبر التهاب النفرونات (الكلية) الجرثومي الموضعي الحاد من اعقد اشكال التهاب الكبب و الكلية و تشخيصه يرتكز على القصة السريرية و التصوير الشعاعي.
و فيما يلي الخطوات التشخيصية لالتهاب الجهاز البولي التي توصي بها الاكاديمية الامريكية لطب الاطفال :
